Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXA2O43364 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms