Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DXG7 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DXG7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DXG7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DXG7 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DXG7 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DXG7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
B4DXG7 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
B4DXG7 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
B4DXG7 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
B4DXG7 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
B4DXG7 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
B4DXG7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
B4DXG7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
B4DXG7 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DXG7 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DXG7 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DXG7 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DXG7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DXG7 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DXG7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DXG7 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DXG7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DXG7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DXG7 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DXG7 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DXG7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DXG7 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DXG7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DXG7 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DXG7 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DXG7 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DXG7 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DXG7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DXG7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DXG7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DXG7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DXG7 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DXG7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DXG7 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DXG7 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DXG7 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DXG7 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DXG7 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DXG7 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DXG7 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DXG7 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DXG7 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DXG7 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DXG7 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DXG7 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DXG7 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DXG7 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DXG7 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DXG7 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DXG7 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DXG7 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DXG7 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DXG7 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DXG7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DXG7 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DXG7 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DXG7 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DXG7 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DXG7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DXG7 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DXG7 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DXG7 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DXG7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DXG7 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DXG7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DXG7 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DXG7 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DXG7 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DXG7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DXG7 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DXG7 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DXG7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DXG7 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DXG7 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DXG7 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DXG7 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DXG7 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DXG7 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DXG7 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DXG7 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DXG7 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DXG7 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DXG7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DXG7 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DXG7 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DXG7 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DXG7 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DXG7 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DXG7 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DXG7 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DXG7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DXG7 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DXG7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DXG7 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms