Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTLL13PA6NNM8 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TTLL13PA6NNM8 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTLL13PA6NNM8 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TTLL13PA6NNM8 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL13PA6NNM8 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL13PA6NNM8 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL13PA6NNM8 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL13PA6NNM8 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL13PA6NNM8 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL13PA6NNM8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL13PA6NNM8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL13PA6NNM8 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL13PA6NNM8 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL13PA6NNM8 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL13PA6NNM8 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL13PA6NNM8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL13PA6NNM8 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL13PA6NNM8 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL13PA6NNM8 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL13PA6NNM8 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL13PA6NNM8 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL13PA6NNM8 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL13PA6NNM8 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL13PA6NNM8 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL13PA6NNM8 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL13PA6NNM8 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL13PA6NNM8 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL13PA6NNM8 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL13PA6NNM8 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL13PA6NNM8 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL13PA6NNM8 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL13PA6NNM8 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL13PA6NNM8 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL13PA6NNM8 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL13PA6NNM8 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL13PA6NNM8 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL13PA6NNM8 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL13PA6NNM8 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TTLL13PA6NNM8 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTLL13PA6NNM8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms