Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms