Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRCP1A6NGW2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRCP1A6NGW2 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms