Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF25A6NGN4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRAMEF25A6NGN4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRAMEF25A6NGN4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRAMEF25A6NGN4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
PRAMEF25A6NGN4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRAMEF25A6NGN4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms