Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT87PA6NCN2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms