Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSDA5PKW4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms