Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIPSLA2A3N6 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIPSLA2A3N6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms