Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC1Q9Y5R8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms