Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms