Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT52Q9Y366 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms