Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC8Q9Y2L5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms