Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX6Q9UNH7 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms