Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNRF3Q9ULT6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms