Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMCC3Q9ULS5 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMCC3Q9ULS5 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMCC3Q9ULS5 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMCC3Q9ULS5 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMCC3Q9ULS5 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMCC3Q9ULS5 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMCC3Q9ULS5 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMCC3Q9ULS5 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMCC3Q9ULS5 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMCC3Q9ULS5 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMCC3Q9ULS5 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMCC3Q9ULS5 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMCC3Q9ULS5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMCC3Q9ULS5 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMCC3Q9ULS5 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMCC3Q9ULS5 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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TMCC3Q9ULS5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMCC3Q9ULS5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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TMCC3Q9ULS5 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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TMCC3Q9ULS5 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMCC3Q9ULS5 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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TMCC3Q9ULS5 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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TMCC3Q9ULS5 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMCC3Q9ULS5 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMCC3Q9ULS5 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMCC3Q9ULS5 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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TMCC3Q9ULS5 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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TMCC3Q9ULS5 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCC3Q9ULS5 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCC3Q9ULS5 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCC3Q9ULS5 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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TMCC3Q9ULS5 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCC3Q9ULS5 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCC3Q9ULS5 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCC3Q9ULS5 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCC3Q9ULS5 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCC3Q9ULS5 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCC3Q9ULS5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCC3Q9ULS5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCC3Q9ULS5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCC3Q9ULS5 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMCC3Q9ULS5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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