Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FBXL4Q9UKA2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FBXL4Q9UKA2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms