Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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RABGEF1Q9UJ41 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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RABGEF1Q9UJ41 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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RABGEF1Q9UJ41 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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RABGEF1Q9UJ41 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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RABGEF1Q9UJ41 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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RABGEF1Q9UJ41 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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RABGEF1Q9UJ41 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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RABGEF1Q9UJ41 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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RABGEF1Q9UJ41 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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RABGEF1Q9UJ41 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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RABGEF1Q9UJ41 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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