Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MLH3Q9UHC1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MLH3Q9UHC1 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms