Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms