Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP36Q9P275 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms