Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MBD5Q9P267 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms