Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PHRF1Q9P1Y6 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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