Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI7

KRCC1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRCC1Q9NPI7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRCC1Q9NPI7 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms