Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FZD3Q9NPG1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms