Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARFGAP3Q9NP61 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms