Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
C11orf49Q9H6J7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C11orf49Q9H6J7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms