Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZV1

UBXN6, UBX domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6Q9BZV1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN6Q9BZV1 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN6Q9BZV1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN6Q9BZV1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN6Q9BZV1 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN6Q9BZV1 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN6Q9BZV1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN6Q9BZV1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN6Q9BZV1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN6Q9BZV1 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN6Q9BZV1 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN6Q9BZV1 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN6Q9BZV1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN6Q9BZV1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN6Q9BZV1 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN6Q9BZV1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN6Q9BZV1 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN6Q9BZV1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN6Q9BZV1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN6Q9BZV1 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN6Q9BZV1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN6Q9BZV1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN6Q9BZV1 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN6Q9BZV1 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN6Q9BZV1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN6Q9BZV1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN6Q9BZV1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN6Q9BZV1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN6Q9BZV1 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN6Q9BZV1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN6Q9BZV1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN6Q9BZV1 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN6Q9BZV1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN6Q9BZV1 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN6Q9BZV1 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN6Q9BZV1 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN6Q9BZV1 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN6Q9BZV1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms