Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV44

THUMPD3, THUMP domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3Q9BV44 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
THUMPD3Q9BV44 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THUMPD3Q9BV44 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THUMPD3Q9BV44 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THUMPD3Q9BV44 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THUMPD3Q9BV44 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THUMPD3Q9BV44 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THUMPD3Q9BV44 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THUMPD3Q9BV44 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THUMPD3Q9BV44 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THUMPD3Q9BV44 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THUMPD3Q9BV44 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THUMPD3Q9BV44 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
THUMPD3Q9BV44 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THUMPD3Q9BV44 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THUMPD3Q9BV44 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THUMPD3Q9BV44 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THUMPD3Q9BV44 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THUMPD3Q9BV44 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THUMPD3Q9BV44 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
THUMPD3Q9BV44 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THUMPD3Q9BV44 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THUMPD3Q9BV44 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THUMPD3Q9BV44 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THUMPD3Q9BV44 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THUMPD3Q9BV44 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THUMPD3Q9BV44 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THUMPD3Q9BV44 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THUMPD3Q9BV44 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THUMPD3Q9BV44 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THUMPD3Q9BV44 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THUMPD3Q9BV44 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
THUMPD3Q9BV44 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THUMPD3Q9BV44 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THUMPD3Q9BV44 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THUMPD3Q9BV44 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
THUMPD3Q9BV44 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THUMPD3Q9BV44 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THUMPD3Q9BV44 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THUMPD3Q9BV44 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THUMPD3Q9BV44 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
THUMPD3Q9BV44 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms