Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SYT17Q9BSW7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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