Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SEMA3CQ99985 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms