Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SORCS2Q96PQ0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SORCS2Q96PQ0 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms