Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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