Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms