Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPUSD4Q96CM3 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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