Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD2Q96BF3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms