Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NEIL2Q969S2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms