Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BHMTQ93088 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms