Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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