Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMB4Q86W47 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms