Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZBED9Q6R2W3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms