Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NANOGP8Q6NSW7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NANOGP8Q6NSW7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms