Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms