Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT28

FAM27B, Protein FAM27A/B/C, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27BQ5VT28 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM27BQ5VT28 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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