Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LDLRAP1Q5SW96 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LDLRAP1Q5SW96 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LDLRAP1Q5SW96 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LDLRAP1Q5SW96 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LDLRAP1Q5SW96 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LDLRAP1Q5SW96 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LDLRAP1Q5SW96 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LDLRAP1Q5SW96 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LDLRAP1Q5SW96 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LDLRAP1Q5SW96 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LDLRAP1Q5SW96 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LDLRAP1Q5SW96 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LDLRAP1Q5SW96 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LDLRAP1Q5SW96 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LDLRAP1Q5SW96 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LDLRAP1Q5SW96 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LDLRAP1Q5SW96 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LDLRAP1Q5SW96 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LDLRAP1Q5SW96 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LDLRAP1Q5SW96 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LDLRAP1Q5SW96 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LDLRAP1Q5SW96 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LDLRAP1Q5SW96 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms