Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BRMS1LQ5PSV4 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BRMS1LQ5PSV4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms