Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC109830.1-203ENST00000506638 467 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 FAM230B-204ENST00000421576 598 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CACNA1C-AS1-203ENST00000544517 742 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 MIR4459-201ENST00000581837 66 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC239600.1-201ENST00000603201 462 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP20-1Q3LI63 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.3 ms