Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPHKAPQ2M3C7 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
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