Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ISXQ2M1V0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ISXQ2M1V0 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms