Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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NDUFA9Q16795 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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NDUFA9Q16795 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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NDUFA9Q16795 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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NDUFA9Q16795 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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NDUFA9Q16795 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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NDUFA9Q16795 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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NDUFA9Q16795 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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NDUFA9Q16795 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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NDUFA9Q16795 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NDUFA9Q16795 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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